以特殊的后發酵工藝加工而成的六堡茶屬于黑茶，黑茶可不像綠茶那樣越新鮮越好喝，反而是越放越陳越香，所以在平日里多買點也無妨，只要茶葉存儲保存得當可以邊放邊品嘗，隨著時間的沉淀六堡茶的陳香愈濃品質越佳。
但有不少想要收藏六堡茶的茶友表示六堡茶放家里儲藏久了會出現一股霉味，這是因為六堡茶對儲藏存放的條件也有一定要求，不只是溫度濕度，就連光照和氧氣等因素都會影響到六堡茶的品質好壞，只有適當的溫度和濕度才能讓六堡茶順利陳化，而雜味串雜，陽光曝曬等因素則會讓六堡茶的品質變差。那么六堡茶該如何存放呢？
首先要注意遠離香味怪味或其他污染物。包括六堡茶在內的茶葉都得遠離異味物品，因為茶葉有容易吸附異味的特質。因此在保存六堡茶時一定要注意讓六堡茶遠離樟腦丸，香木香皂等氣味濃厚的物品，還有要遠離其他各種污染物。如果六堡茶染上了異味或污染物就很難消除異味。
其次應當注意要避免陽光照射和雨淋或潮濕的環境。把六堡茶長期置于陽光低下照射對六堡茶的品質有極大的影響，而雨淋則會讓六堡茶發生霉變變質，所以六堡茶一定要保存在沒有陽光照射或不潮濕的地方。
其實六堡茶并不是太挑保存的地方，只要是在無陽光照射和雨淋或潮濕的環境地方，無論是閣樓亦或者是倉庫都可以存放六堡茶。如果是非茶磚茶果的散裝六堡茶，無論是牛皮紙或者是棉紙等無味包裝做成的干凈紙箱都可以存放。
最后保持存儲環境通風干燥。保存六堡茶不宜密閉，一定要保持通風干燥，石灰塊保藏法”、“熱水瓶保藏法”、“抽氣保藏法”等等方法都是針對綠茶這一類的茶葉，完全不適合用于屬于黑茶的六堡茶。
現在市面上販賣的六堡茶一般都是直接放入圓肚平底的小竹簍，這種包裝的用意就是為了讓竹簍中的六堡茶通風透氣，而用牛皮紙或宣紙等干凈包裝成茶磚的六堡茶可以將紙張剝開之后放進陶甕瓷甕或者家里有的竹簍里，甕器不用密封好讓茶葉稍微透氣。
如果是帶有倉味的六堡茶可以先放置在空氣一段時間里，等到倉味散掉后再進行保存。而且在一定的濕度下有利于茶葉品質的轉化，過于干燥會影響像金花（冠突散囊菌）這樣的有益菌群生長。春季回潮濕度較大不宜頻繁翻動存儲環境，否則六堡茶很容易受潮發生霉變。